Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcn2O88968 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcn2O88968 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms