Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcn3O88705 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms