Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hcn2O88703 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms