Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ComtO88587 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ComtO88587 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ComtO88587 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ComtO88587 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ComtO88587 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ComtO88587 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ComtO88587 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ComtO88587 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ComtO88587 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ComtO88587 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ComtO88587 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ComtO88587 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ComtO88587 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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ComtO88587 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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ComtO88587 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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ComtO88587 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ComtO88587 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ComtO88587 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ComtO88587 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ComtO88587 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ComtO88587 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ComtO88587 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ComtO88587 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ComtO88587 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms