Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dync1i1O88485 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms