Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms