Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CaskO70589 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CaskO70589 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CaskO70589 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CaskO70589 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms