Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51dO55230 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51dO55230 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms