Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms