Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ptpn20O55082 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn20O55082 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn20O55082 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ptpn20O55082 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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