Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6bO54951 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms