Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3O54890 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms