Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DffaO54786 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DffaO54786 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DffaO54786 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DffaO54786 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DffaO54786 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms