Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp100O35892 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp100O35892 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp100O35892 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms