Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CaluO35887 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CaluO35887 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CaluO35887 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CaluO35887 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CaluO35887 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CaluO35887 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaluO35887 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaluO35887 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CaluO35887 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms