Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cited2O35740 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cited2O35740 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cited2O35740 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cited2O35740 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cited2O35740 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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