Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms