Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk3O35492 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk3O35492 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clk3O35492 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms