Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Clk2O35491 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Clk2O35491 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Clk2O35491 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Clk2O35491 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Clk2O35491 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Clk2O35491 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clk2O35491 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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