Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1dO35473 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1dO35473 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C1dO35473 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1dO35473 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1dO35473 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1dO35473 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms