Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema6aO35464 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms