Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Capn1O35350 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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