Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d1bO35324 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms