Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
E2f3O35261 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f3O35261 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms