Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad6O35182 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad6O35182 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad6O35182 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms