Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Polr1aO35134 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms