Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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H2-Q1O19441 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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H2-Q1O19441 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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H2-Q1O19441 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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H2-Q1O19441 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Q1O19441 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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H2-Q1O19441 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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H2-Q1O19441 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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H2-Q1O19441 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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H2-Q1O19441 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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H2-Q1O19441 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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H2-Q1O19441 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Q1O19441 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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H2-Q1O19441 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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