Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eftud2O08810 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms