Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClockO08785 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClockO08785 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClockO08785 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClockO08785 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms