Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdx6O08709 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdx6O08709 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms