Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec22bO08547 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms