Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efna5O08543 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Efna5O08543 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms