Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6871L7N248 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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