Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20878L7N244 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20878L7N244 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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