Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20939L7N243 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20939L7N243 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms