Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2035J3QP87 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms