Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm5294J3QP53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5294J3QP53 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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