Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930544D05RikJ3QK56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930544D05RikJ3QK56 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms