Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34c3J3QJW5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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