Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pot1bH7BX60 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms