Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn20G5E8X0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn20G5E8X0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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