Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r34G3XA52 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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