Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms