Protein–RNA interactions for Protein: F7CFJ3

Gm8232, Predicted gene 8232 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8232F7CFJ3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8232F7CFJ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8232F7CFJ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8232F7CFJ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8232F7CFJ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8232F7CFJ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8232F7CFJ3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8232F7CFJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8232F7CFJ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms