Protein–RNA interactions for Protein: F7C9A1

Gm3327, Predicted gene 3327 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3327F7C9A1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3327F7C9A1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3327F7C9A1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms