Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms