Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm42421F6X8D5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm42421F6X8D5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms