Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930451I11RikE9Q9R3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms