Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrdnE9Q9K5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TrdnE9Q9K5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TrdnE9Q9K5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TrdnE9Q9K5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms