Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms